番茄晚疫病的防治方法主要以农业防治和化学防治为主。首先种植抗病品种，如百利、L-402、中蔬4号、中蔬5号、中杂4号、圆红、渝红2号、强丰、佳粉15号、佳粉17号等，再进行轮作换茬，加强田间管理，合理密植。条件许可时可与非茄科蔬菜实行3-4年轮作。选择地势高燥、排灌方便的地块种植，合理施用氮肥，增施钾肥。切忌大水漫灌，雨后及时排水。加强通风透光，保护地栽培时要及时放风，避免植株叶面结露或出现水膜，以减轻发病程度。
培育无病壮苗：病菌主要在土壤或病残体中越冬，因此，育苗土必须严格选用没有种植过茄科作物的土壤，提倡用营养钵、营养袋、穴盘等培育无病壮苗。清洁田园：番茄、黄瓜、辣椒、芹菜等作物收获后，彻底清除病株、病果，减少初侵染源。经常检查植株下部靠近地面的叶片，一旦发现中心病株，立即除去病叶、病枝、病果或整个病株，在远离田块的地方深埋或烧毁，同时立即施杀菌农药和连续消毒，防止病害蔓延。
避免在有番茄晚疫病的棚内育苗，定植前仔细检查剔除病株，并喷1次药。雨季及时排涝，降低田间湿度。在疫病大范围发生时，喷洒农药是防治疫病最有效的方法，但要注意喷洒药液要及时、周到，以防为主。推荐使用10%氰霜唑悬浮剂1500倍液，或50%烯酰吗啉可湿性粉剂1500倍液，或68.75%氟菌·霜霉威悬浮剂1000倍液，或10%氟噻唑吡乙酮可分散油悬浮剂5000倍液等喷雾防治，喷药时要细致全面，才能取得较好的防治效果。
波尔多液：按1：1：200的比例兑药，即用500克硫酸铜和500克生石灰，兑上100公斤水，具体做法是：先用少量的水把石灰化开，再兑水制成石灰水。在另一个桶里，也先用少量的水把硫酸铜化开，再兑水制成硫酸铜液，然后把硫酸铜液慢慢地倒入石灰水里，边倒边搅拌，就成了天蓝色的波尔多液了。
农业防治：清除田边杂草及收获后的枯枝烂叶，集中销毁，以减少螨源。药剂防治：将此虫消灭在点片发生期。73%的炔螨特1500倍液喷雾；25%的杀螨猛1000～1500倍液喷雾。2.5%的氯氟氰菊酯乳油4000倍液喷雾。2.5%联苯菊酯乳油或5%尼索郎乳油3000～4000倍液喷雾。以上药剂每7～10天喷1次，连防2～3次。
