小麦纹枯病发病适温16℃~20℃。凡冬季偏暖，早春气温回升快，阴雨天气多，光照不足的年份发病重；冬小麦播种过早、秋苗期病菌浸染机会多。病害的发生发展与日均温度关系密切。当日均温度在10℃以下时，病害发展缓慢；日均温度超过15℃，病情加重；20-25℃则迅速发展，病株率和病害严重度都急剧上升；当气温达30℃左右时，病害发展基本停止。春季多雨潮湿的天气，有利于病菌的发生和发展。
栽培因素如冬麦播种过早、密度过大、偏施氮肥、麦苗生长过旺，发病重。常年连作、麦田草害严重、土壤或田间湿度过大，发病重。施用带病残株而未经腐熟的粪肥等，也有利于发病。属于土传性病害，小麦玉米轮作，土壤中的病菌增加，播种过早，气温高，旺长，浇水大，积水多，田间湿度大，都会加重纹枯病的发生。
在田间湿度大，通气性不好的条件下，病鞘与茎秆之间或病斑表面，常产生白色，或土黄色、黄褐色霉状物(菌丝)，上面长出担孢子，单细胞，椭圆形或长椭圆形，基部稍尖，无色。这个病是典型的土传病害，病原菌主要以菌核、菌丝体在土壤中或病残体中越冬，作为第二年的初侵染源；带有病残体和病土的未腐熟的有机肥也可以传病。此外，农事操作也可传播。
