1、播种质量：种植在粘性较重的土壤上，播种过深，土壤通透性差，影响种子萌芽。
2、包衣药害：农户包衣时用药剂量过多或包衣不均匀，导致胚芽受损，影响正常发芽。
3、肥料烧苗：施入底肥或种肥时未做好隔离措施，种子与浓肥直接接触，易造成烧芽或烧根。
4、温度过低：播种后温度低且土壤湿度大、透气性差，影响种子芽的分化。
5、地下虫害：播种后遭地下害虫啃食芽或根，导致种子不能正常生长。
6、除草剂药害：播种前后除草时药剂使用不当，药液下渗影响种子发芽、生根。
7、冻害：种子收获后未及时干燥处理，受低温冻害，胚根和胚芽冻伤，影响正常发育。
8、机械损伤：制种过程中胚芽或胚根受器械损伤，导致不能正常萌发。
9、高温危害：中午温度高、持续时间长，高温闷种和烫伤现象严重，尤其土壤粘重地块大水漫灌时更严重。有的玉米种子根长出后，胚芽刚出种皮被晒死，导致有根无芽。
