烟草青枯病茎发病时，出现长形黑色条斑，有的条斑扩展到病株顶部或枯萎的叶柄上。到发病中后期，全部叶片萎蔫，条斑表皮变黑腐烂，病株茎和叶脉导管变黑，根部也变黑腐烂，甚至茎髓部呈蜂窝状或全部腐烂形成空腔，仅留木质部。根、茎、叶各部均可受害，最典型的症状是植株枯萎。发病萎垂的叶片，初期仍为青色，故称“青枯病”。烟株发病后，先是茎和叶脉里的导管变黑，随着病情的发展，病菌侵入皮层及髓部，外表出现黑色条斑。在发病初期，田间病株常表现一边枯萎，易与黑胫病整株枯死相区别，病株虽表现一边枯萎，但无低头现象。如将病株连根拔出，可以看到发病一侧的维管束变成黄褐或黑褐色。病菌继续扩展，茎上开始出现黑色纵长条斑，有时条斑一直伸展到病株的顶部，甚牵达到枯萎的叶柄上。茎上出现黑色条斑是本病害的主要特征。在发病中期，病株全部叶片萎蔫，条斑的表皮组织变黑腐烂，根部亦变黑腐烂，这时如将病茎横切，用力挤压切口，导管中即渗出乳白色的粘液，即菌脓。病茎的髓部呈蜂窝状或全部腐烂，形成仅残留木质部的空腔。病株茎部外观可见纵向的黑色条斑，可延至植株顶尖部。有时病株一侧先发病枯萎，相应一侧根部变黑腐烂，称为“半边疯”。严重时，叶片上会出现大面积水渍状坏死斑。剖视病株茎秆可见维管束变褐色，含水量较高的部分用手挤压，可见导管中渗出黄色汁液，即为细菌溢脓。