甘蔗的病害有凤梨病、眼斑病、黄斑病、黑穗病、赤腐病、花叶病、宿根矮化病等，虫害主要有蔗螟(俗称甘蔗钻心虫)以及绵蚜、红粉蚧、蔗龟金龟子、甘蔗棉蚜、甘蔗飞虱、甘蔗蓟马等。甘蔗上主要虫害是蚜虫、金针虫、蝼蛄，主要病害是凤梨病、眼斑病、黑穗病。甘蔗的病虫害主要有以下几种：1、甘蔗根部害虫即地下害虫，主要有金针虫、蝼蛄、金龟子、白蚁、蟋蟀等。2、甘蔗叶面害虫主要为刺吸式害虫，有绵蚜、黄蚜、蓟马、蔗飞虱、蔗叶蟑、粉蚧、蝽蟓、螨类等。3、甘蔗茎部害虫主要为钻蛀性害虫，有二点螟、条螟、大螟、黄螟、白螟、台湾稻螟等。这些都是甘蔗的重大威胁。
1、凤梨病。该病害主要是因为种子染病引起的，发生病害后，甘蔗会呈现凤梨般的香味，切口处出现红色，后期种苗就会变黑。该病害危害性较大，影响甘蔗种子的发芽，使幼苗生长虚弱，危害严重会导致甘蔗死亡。防治方法：在甘蔗种植的时候覆盖上地膜，防止病虫害侵袭，同时还可以选用3%的水石灰浸种，砍伐后的根块需要给予多菌灵和蔗茎灵联合消毒处理。
2、黑穗病。该病害发生后，甘蔗蔗茎顶端部生长出一条黑色鞭状物，发生该病害主要是由于高温高湿环境引起，会影响甘蔗的正常发育。防治方法：种植甘蔗时，用0.5%甲氧乙氯汞浸种，并给甘蔗增加磷钾肥料，实行轮作的方式，可以有效减少病害发生。
