防治马铃薯晚疫病必须选用无病种薯进行种植，并用68%甲霜锰锌拌种。在马铃薯幼苗期和地下块茎膨大期，每10—15天叶面喷洒一次1500倍50%烯酰吗啉可湿性粉剂水溶液，或1000倍25%嘧菌酯悬浮剂水溶液，或700倍72%霜脲锰锌可湿性粉剂水溶液，或800倍50%烯酰锰锌可湿性粉剂水溶液进行预防，连续喷洒2—3次。发病后每7—10天叶面喷洒一次1000倍64%杀毒矾可湿性粉剂水溶液，或800倍69%甲霜锰锌可湿性粉剂水溶液，或800倍80%代森锰锌可湿性粉剂水溶液进行防治，连续喷洒2—3次，均匀喷湿所有叶片，以开始有水珠往下滴为宜。
选育抗病品种。马铃薯不同品种对晚疫病的抗病能力有很大差别，应选用具有水平抗病性的品种。建立无病留种地和选用无病种薯。无病留种田应与大田相距2.5cm以上，减少病原菌传播侵染的机会，并严格实行各种防治措施，可在发病轻的地块选择无病植株，单收、单藏，留种。种薯处理。用内吸性杀菌剂浸种，如50%多菌灵500倍液浸种，也可用200倍福尔马林溶液浸种，然后堆积并覆盖严密，闷种2小时，再摊开晾干。加强栽培管理。播种前精选种薯，淘汰带菌块茎，减少田间中心病株的数量。在马铃薯生长后期培土可减少游动孢子囊侵染薯块的机会。在病害流行年份，适当提早割蔓，2周后再收取薯块，避免薯块与病株接触机会，降低薯块带菌率。药剂防治。当田间出现中心病株时，立即清除中心病株，喷洒1~2%硫酸铜液，每7天喷1次，连续喷2~3次。
