1.选种及种子消毒。种植前先将种子放入52℃-56℃的温水中浸种25分钟-30分钟，能收到较好的杀菌效果。留种时应从无病果中选取种子，减少种子带菌。
2.注意选地，高畦深沟。高温多湿是炭疽病发生的有利条件，因此栽培苦瓜应选择地势较高的田块。要高畦深沟，并注意排水，适当密植。
3.药剂防治。苦瓜在幼果期和高温多雨天气容易发病，要连续喷药防病，每隔7天-10天喷1次50%多菌灵500倍-600倍药液。发病初期可喷洒苯甲醚菌酯、吡唑醚菌酯、苯甲.丙环唑等对症药剂。
4.轮作与非瓜类作物轮作，合理休耕轮作，减少病害发生。
5.加施药土，定植时沟施或穴施，增强植株抗病能力。
6.合理施肥，通风排湿，采用生物农药防治，综合运用物理和化学方法，有效控制苦瓜炭疽病的发生。
