瓜实蝇一年发生5～8代，世代重叠明显。全年均有活动，以老熟幼虫和蛹在土中越冬。每年3～4月气温升至10℃以上时，蛹羽化为成虫，成虫羽化后7～14天开始交尾产卵于瓜内，孵化的幼虫直接在瓜内取食为害。成虫白天活动，夏季高温时多静伏于瓜棚或叶背，晚上基本不活动，对糖、醋等有趋性，多产卵于嫩瓜中。幼虫老熟后从瓜内爬出落地化蛹，约一周后羽化为成虫。
在湖南，5～8月为幼虫为害高峰期，6～9月是瓜实蝇生长发育的高峰期。第1代在4～5月，主要为害黄瓜；第2代在6～7月，为害黄瓜和苦瓜；第3代在8～9月，为害苦瓜和丝瓜，其中第2、3代为害较重。成虫和幼虫均可为害，成虫以产卵管刺入幼瓜表皮产卵，导致瓜表面出现刺伤孔，局部变黄、畸形、软腐、下陷等症状；幼虫在瓜内蛀食，将瓜内部蛀成蜂窝状，严重时全瓜腐烂变臭，造成大量落瓜。
