底肥以有机肥为主,应占作物一生总需肥量的60%。保护地生产宜选用养分含量较高的鸡粪、猪粪,但需充分腐熟,以杀灭肥料中的虫卵及病菌。有机蔬菜对土壤、水源、空气、物料投入、采收加工、贮藏运输均有严格要求,并通过认证取得合格证及标识。