甜瓜白粉病主要危害叶片，逐步蔓延至叶柄及茎蔓。发病初期，叶片正、背面出现白色小粉点，逐渐扩展成近圆形白色粉斑，多个病斑相互连接，使叶面布满白粉。随着病害发展，粉斑颜色逐渐变为灰白色，后期在粉层下产生黄褐色至黑色小粒点，即病原菌闭囊壳，最终导致病叶枯黄坏死。严重时，瓜面上也可长出白色粉状物，即病菌的菌丝体和分生孢子。
白粉病病菌属于专性寄生菌，寄生能力强，菌丝体或分生孢子萌发后可直接通过气孔或表皮侵入寄主器官。由于叶片背面气孔数量较多，病菌在叶片背面侵入的几率更高。在温暖湿闷的气候条件下，氮肥施用过多或不足会导致甜瓜植株过旺或发育不良，增加发病风险。雨后干燥但田间湿度大时，白粉病会迅速扩散，导致甜瓜座果率增加，抗病力下降，病情不断蔓延。甜瓜全生育期均可发生此病。
