柑橘黄龙病的主要症状包括叶片、枝梢、花部和根部的异常表现。发病初期，部分新梢叶片黄化，出现“黄梢”，从顶端叶片开始，逐渐向下蔓延，1～2年后全株发病，3~4年后失去经济价值。叶片斑驳，叶肉变厚、硬化，叶表无光泽，叶脉肿大，有些肿大的叶脉背面破裂，似缺硼症。病树开花早而多，花瓣较短小，肥厚，淡黄色小枝头花朵成团，称“打花球”。根部主要表现为腐烂。
柑橘黄龙病典型症状有黄梢型、黄斑型、缺素型三种。黄梢型表现为病树外围部分枝条或树顶新梢叶片黄化，多发生于初发病树和夏、秋梢上，黄化的叶片极易脱落。黄斑型表现为叶基部、叶脉附近或边缘褪绿黄化，并逐渐扩大成黄绿相间的不均匀病斑，春、夏、秋梢上均有发生。缺素型表现为果小而畸形，病叶小，叶脉间叶肉呈淡黄或黄色，与缺乏锌、锰、铁等微量元素的症状相似。
柑橘黄龙病会导致叶片出现黄化、脆、硬等特点，叶脉肿大，叶面不平整，无光泽。树叶黄化主要包括均匀黄化型、斑驳黄化型、缺素状黄化型等类型。枝梢症状表现为树冠外围出现少量营养不良的枝梢，呈现出明显的黄梢，而黄梢以下的叶片则正常。花部症状表现为病树开花不一致，相较于健康树易出现提前开花，花瓣易脱落。根部症状表现为根系腐烂和坏死，腐烂程度随病情蔓延。
黄龙病从顶部叶片开始发病，逐渐向下蔓延，可通过日常观察进行治理和防治。
