黄花菜叶枯病的病原菌以菌丝体、分生孢子梗和分生孢子在病残体上越冬，第二年春季分生孢子通过气流、风雨传播，在平均气温15摄氏度以上，有雨、湿度大时即可萌发长出芽管进行初侵染。发病后又长出大量新的分生孢子，生长季可频频进行再侵染使病情不断加重。霉雨季节雨水多、湿度大，平均温度18-23℃的条件下，适于病害流行。
田间一般4月下旬开始发病，5~6月发病加快，多雨高湿发病严重。连续种植黄花菜或排水不良，或叶螨危害猖獗发病重。种植密度大、通风透光不好，发病重，氮肥施用太多，生长过嫩，抗性降低易发病。土壤黏重、偏酸；多年重茬，田间病残体多；肥力不足、耕作粗放、杂草丛生的田块，植株抗性降低，发病重。种苗带菌、肥料未充分腐熟、有机肥带菌或肥料中混有本科作物病残体的易发病。地势低洼积水、排水不良、土壤潮湿易发病；气候温暖、春雨绵绵、霉雨季节连阴雨发病。