花单性,雌雄异株。雄花排列成穗状花序,顶生或腋生,花被4,黄绿色,雄蕊4,伸出;雌花簇生于叶腋,花被坛状,有2齿,花柱4,线形,细长,下部结合。胞果硬,通常有2个角刺。花期夏季。菠菜因雌雄异株,所以是异花授粉。