胡萝卜菌核病是胡萝卜种植中常见的一种真菌病害，主要发生在田间和贮藏期，为害肉质根。田间发病时，植株地上部根茎处腐烂，地下肉质根软化，组织腐朽呈纤维状，中空，病部外生白色棉絮状菌丝和黑色鼠粪状菌核。贮藏期肉质根染病，症状类似。该病由子囊菌亚门的瓜核盘菌引起，主要表现为叶片表面出现大量大小不一的灰斑。
发病初期，肉质根表面产生污垢状斑点，随着病程延长，斑点扩展成不规则形、水浸状、褐色病斑。病斑多在肉质根的上半部出现，向上扩展至叶柄基部，使叶柄基部呈褐色立枯状。空气湿度较大时，病斑上出现污白色蛛丝状菌丝，病斑也软化腐烂。生育期发病时，植株地下肉质根受害，顶部或向阳面初现水渍状斑，后期变成褐色湿腐，稍凹陷。病斑表面长出白色菌丝体，后期形成不规则菌核，继而肉质根软化、腐烂。潮湿环境下，肉质根表面出现白色绵状菌丝体和鼠粪状菌核。贮藏期胡萝卜菌核病可继续发生，造成烂窖。目前该种病害可以通过施用农药等方式来防治。
