苗期发病首先会在茎基部形成暗绿色的水渍状病斑,之后植株会迅速地因褐腐缢缩而猝倒,有时茎基部会呈黑褐色,严重时幼苗会枯萎死亡;成株期若叶片感病则会出现病斑,病斑呈圆形或近圆形,边缘为黄绿色,中央为暗褐色;椒果发病多从蒂部开始,病斑为水渍状,暗绿色,扩大后可遍及整个椒果,潮湿时椒果表面会产生霉层。叶片呈现黄绿相间斑驳花叶。后期植株矮化,果实上出现深绿和浅绿相间花斑;果实上有疣状突起;果实畸形,易脱落。辣椒病毒病的主要表现症状是叶片上出现热水浸状斑点,叶片逐渐发黄楛死,果实上出现斑点或黑绿色,最后不成熟就脱落。辣椒病毒病主要有花叶型、畸形、坏死型、条斑型。其中坏死型发病急,传播速度快,会引起三落,导致整株辣椒干枯。辣椒病毒病是由黄瓜花叶病毒、烟草花叶病毒等60多种病毒引起的、发生在辣椒的病害。症状主要有四种类型:花叶型、黄化型、坏死型及畸形型。花叶型在叶片上产生黄绿相间的斑驳或大型黄褐色环斑;黄化型叶片黄化或出现坏死斑;坏死型在叶片、茎秆上岀现褐色坏死斑;畸形型导致叶片出现皱缩畸形。