大豆根腐病主要危害根部,在幼苗或植株期间均可感染。初期症状为根部茎叶表皮出现淡红褐色不规则小斑,随后发展为红褐色凹陷坏死斑。病斑扩展至根皮枯死,导致根系不发达,根瘤少,地下部矮小瘦弱。叶片呈淡绿色,分枝和结荚较少。种子出土前受害腐烂,表面附着白色霉菌。幼苗期根部病斑起初为褐色或黑褐色斑点,后扩展为菱形或长条形凹陷斑块,严重时呈铁锈色或红褐色及黑褐色,皮层腐烂如溃疡,侧根由根尖开始变褐、水浸状并逐步腐烂,重病株主根及须根全部腐烂,形成“秃根”。病株地上部分发育不良,矮小瘦弱,叶片发黄,严重时干枯死亡。成株期根部形成不规则褐色斑,严重时根系开裂,木质纤维组织外露,叶片自下而上逐渐变黄,植株矮化,比健康植株矮6~8公分。开花结荚期为最高发病期,田间可见大量黄叶,轻者虽能缓慢生长,但叶片由黄转脱落,结荚少,子粒小,产量降低。