向日葵锈病是向日葵的重要病害，大流行年份可导致减产40%～80%。该病可侵染叶片、叶柄、茎秆、葵盘等部位，形成铁锈状孢子堆。叶片染病初期，背面出现褐色小疱，即病菌夏孢子堆，表面破裂后散出褐色粉末状的夏孢子。随后，病部生出黑褐色小疱，即病菌冬孢子堆，散出黑色粉末状的冬孢子，严重时导致叶片早期干枯。
在寒冷地区，病菌以冬孢子在病残体上越冬。翌年条件适宜时，冬孢子萌发产生担孢子侵入幼叶，形成性子器，后在病斑背面产生锈子器，器内锈孢子飞散传播，萌发后从叶片侵入，形成夏孢子堆和夏孢子。夏孢子借气流传播，进行多次再侵染。接近收获时，在产生夏孢子堆的地方形成冬孢子堆，又以冬孢子越冬。南方温暖地区，病菌在多年生向日葵或菊芋上以菌丝越冬，越冬后繁殖进行再侵染。
该病的发生与上年累积菌源数量、当年降雨量关系密切，尤其是幼苗和锈孢子出现后，降雨对其流行起重要作用。进入夏孢子阶段后，雨季来得早，可进行多次重复侵染，常引致该病流行。生产上种植中熟品种及食用葵易发病，7～8月份多雨时发病重。
向日葵锈病的病原菌为向日葵柄锈菌，属于担子菌亚门、冬孢子纲、锈菌目、柄锈菌属，是一种单主寄生菌，具有5种孢子。病菌在病落叶及病株残体中越冬，翌年春季借气流传播侵染危害。锈病的发病原因是高温、高湿及透气性差的环境条件，雨水天气偏多、排水不及时等也是重要诱因。