辣椒的病害包括青枯病、疫病、白粉病、猝倒病、茎基腐病、炭疽病、菌核病、灰霉病、褐斑病和病毒病。青枯病导致茎干枯萎,疫病引起腐烂,白粉病使叶子枯黄脱落。虫害有烟青虫、白粉虱、茶黄螨、蚜虫、红蜘蛛、飞虱和棉铃虫,这些害虫会吸取植株汁液。病害多从主茎或侧枝基部开始,初期呈水浸状淡褐色病斑,后变灰白色或灰色,干缩状,湿度大时长出白色絮状霉层,皮层迅速腐烂。病茎表皮及髓部易形成菌核。叶片发病产生水浸状褐色轮纹病斑;花受侵染后水浸状腐烂、脱落。果实发病后褐色腐烂,表面长有白色霉层,后形成菌核;病果腐烂脱落或形成僵果。