土壤菌源多,田间湿度大,若遇阴雨,有利于菠菜猝倒病发生。合理浇水施肥,密度合理,健康载培,不利于病害发生。病菌以卵孢子在表土层越冬,并在土中长期存活。第二年遇到适宜条件萌发产生孢子囊,以游动孢子或直接长出芽管侵入寄主。此外,在土中营腐生生活的菌丝也可产生孢子囊,以游动孢子侵染幼苗引起猝倒。田间的再侵染主要靠病苗上产生孢子囊及游动孢子,借灌溉水或雨水溅附到贴近地面的根茎上引致更严重的发病。发病初期喷洒70%代森锰锌干悬粉500倍液或75%百菌清可湿性粉剂600倍液、50%扑海因可湿性粉剂1500倍液、64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、40%大富丹可湿性粉剂400倍液、47%加瑞农可湿性粉剂1000倍液,视病情防治1次或2次。采收前7天停止用药。