首先，选用抗病品种，是最经济有效的措施；或采用嫁接栽培，可提高苦瓜的抗性，尤其是白粉病、霜霉病、炭疽病有明显的减轻。第二，搭棚引蔓、适时摘除病黄叶，引蔓上棚有利于使其有足够的生长空间，保持良好的通风透光性，苦瓜结瓜颜色好、瓜条正；在苦瓜生长后期，黄叶、病叶、病虫瓜果增多，宜及时摘除并处理，既增加通风透光，又减少病虫害，且方便喷药。第三，合理水肥、控制温湿度是预防炭疽病的关键，尤其棚室栽培，要注意适当通风，保持田间湿度在70%以下，减少结露；采用小水勤浇，避免浇水过大，露地栽培雨季注意通沟排水，保持土壤湿润状态即可；苦瓜开花结果需要大量的养分，建议在初花期施三元复合肥，进入盛瓜期看长势追肥，宜增施氮肥，多施钾肥，补施硼、镁等微肥，提高苦瓜坐瓜率及植株抗病能力。
发病初期喷洒50％甲基硫菌灵？硫磺悬浮剂700倍液加75％百菌清可湿性粉剂700倍液或25％炭特灵可湿性粉剂500倍液、50％施保功可湿性粉剂1500倍液、25％使百克乳油1200倍液、50％苯菌灵可湿性粉剂1000倍液、50％多丰农可湿粉500倍液，2％抗霉菌素(农抗120水剂)或2％武夷菌素(BO－10)水剂200倍液、80％大生可湿性粉剂500倍液，隔7～10天1次，连续防治2～3次。如能混入云大120植物生长调节剂3000倍液，可有药肥兼收之效。采收前7天停止用药。
苦瓜炭疽病:可以选用10%苯醚甲环唑、25%苯甲溴菌腈（炭洁），20%氟硅唑咪鲜胺，43%戊唑醇这些治疗性杀菌剂，同时配合70%代森联，25%嘧菌酯、50%吡唑嘧菌酯这些偏保护性药剂一起使用，治病的同时防病。发病初期喷洒50%甲基硫菌灵可湿性粉剂700倍液加75%百菌清可湿性粉剂700倍液或36%甲基硫菌灵悬浮剂400～500倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液、60%防霉宝超微可湿性粉剂800倍液、50%多丰农可湿粉500倍液，2%抗霉菌素(农抗120水剂)或2%武夷菌素(BO一10)水剂200倍液、80%大生可湿性粉剂500倍液，隔7～10天1次，连续防治2～3次。如能混入喷施宝或植宝素7500倍液，可有药肥兼收之效。采收前7天停止用药。
发病期间及时喷洒75％甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，75％百菌清可湿性粉剂600倍液，或25％炭特灵可湿性粉剂500倍液，25％苯菌灵乳油900倍液，或50％退菌特800至1000倍液，或50％炭福美可湿性粉剂500倍液。隔7至10天一次，连续3至4次，防治效果较好。发病初期选用25%炭特灵可湿性粉剂600倍液，或50%施保功可湿性粉剂1500倍液，或70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液，或25%敌力脱乳油1000倍液，或80%大生可湿性粉剂600倍液，或30%倍生乳油2000倍液，或2%农抗120水剂200倍液，或2%加收米水剂600倍液喷雾。保护地可选用5%百菌清粉尘剂1千克/667m2喷粉防治。
