有机肥不仅供给黄瓜生长发育的各种养分，而且能够减少土壤容重，增加土壤孔隙度，改善土壤的理化性状，对黄瓜持续高产和改良土壤都起着重要作用。生产中应亩施腐熟的圈粪2500～3000公斤或土粪5000公斤。
在黄瓜的不同生长阶段，施肥的方法和种类也有所不同。发芽期主要施加腐熟的有机肥作为基肥，以提供充足的养分支持。幼苗期若田间肥力不足，需追施含氮的化肥，促进黄瓜幼苗的快速生长。到了初花期，应以保证持续养分供给为目标，主要以迟效性有机肥为主。结果期则是黄瓜生长的关键，此时应浇灌稀释后的液态肥，每隔1个星期施一次，以促进果实顺利膨大，保证产量和品质。
