复合肥的有效期较长，只要包装袋不破损、不受潮、不被雨淋或不与碱性物质混放，便可长期存放，有效期可长达20年以上。肥料本身库存时间长短对肥效影响不大，主要是氮肥有稍许挥发及肥料容易结块。保质期主要取决于外包装，外包装一般为聚丙烯材料，在光照下容易风化和破损，因此复合肥厂家通常规定保质期为2年。不过，氮元素在高温环境下会挥发流失，导致肥效降低，所以不建议存放过长时间。复合肥撒在土里的有效期为1个半月左右。目前国家没有对化肥保质期的具体规定，但从肥料特性分析，只要贮存得当，包装完好、不受潮、不与碱性物质混放，一般可长期贮存。