防治番茄绵疫病，应采取预防为主的综合措施。首先，选择三年未种过茄科蔬菜、地势高、排水良好、土质偏沙的地块种植。在定植前精细整地，做到深开沟、高培土以降低土壤含水量。栽培时及时整枝打杈，去掉老叶、膛叶，增加植株间通透性。采用地膜覆盖栽培，避免病原菌通过灌溉水或雨水反溅到植株下部叶片或果实上。加强田间管理，及时摘除病果并深埋或烧毁。
在发病初期，可选用40%三乙磷酸铝可湿性粉剂200倍液、58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液、64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、72.2%普力克水剂800倍液、70%乙磷锰锌可湿性粉剂500倍液、72%杜帮克露或克霜氰可湿性粉剂700-800倍液、69%安克锰锌可湿性粉剂1000倍液、30%绿叶丹可湿性粉剂800倍液、50%甲霜铜可湿性粉剂600倍液、60%琥乙膦铝可湿性粉剂500倍液等药剂进行喷洒防治。重点保护果穗，适当兼顾地面，喷药后1小时内遇到雨需补喷。
