彻底清除病残体,减少田间菌源;与非葱蒜类蔬菜实行2年以上轮作。选择排水良好的地块栽植,雨后及时排水,做到合理密植,通风良好;采用配方施肥,增强寄主抗病力。深沟高畦;合理密植;雨后清除积水。保护田栽培的还应及时做好通风换气工作。收获后及时清除病残体,带出田外集中销毁,减少田间病源菌;深翻土壤,加速病残体的分腐烂和分解。在发病初期开始喷药。药剂可选用75%百菌清600倍液等,喷雾防治。每隔7~10天喷1次,连续喷2~3次。大葱疫病普遍发生在秋冬季节,尤其是阴雨连绵的高湿环境下,地势低洼、排水不畅、种植密度大,植株疯长的地块发病重。