大葱酸霉病是一种常见的病害，尤其在冬季高温多雨或3—4月高温多雨年份更容易发生。以下是病害的防治和管理措施：
选地势平坦、土壤肥沃地块种植。密度适宜以保持株间通风透光良好。做好肥、水管理，防止植株早衰。注意勿偏施、过施氮肥，造成植株徒长，降低抗病能力。适量灌水，灌水后及时中耕。雨后及时排出田间积水，防止湿气滞留。收获后及时清除田间病残体，集中深埋或烧毁。
病害严重的地块，应停止种植大葱，种子要经过水洗后播种。苗床要稀播，适量施肥。选地势高，排水好，通风的地块种植。施足肥料，增施磷钾肥。合理灌水，不使葱地过湿。发现病株，及时拔除埋掉。收获后彻底清除病残体，集中处理，并进行深耕，减少菌源。
另外可以用化学药剂进行防治。大葱酸霉病发病初期开始喷洒50%腐霉利（速克灵）可湿性粉剂2000倍液、45%特克多（噻菌灵）悬浮剂3000倍液、50%扑海因（异菌脲）可湿性粉剂1500倍液、60%防霉宝。
