干旱时要及时浇水，雨后做好排水措施，以免烂根。对于酸性土壤，少施或不施硫酸铵、过磷酸钙等肥料，可通过撒施草木灰调节土壤施基肥。夏季高温时浇水降温，同时注意低温冻害；追施有机肥，为植株提供多种营养成分，施肥要合理，不宜过多。使用药剂时注意浓度，发生药害后及时喷洒缓解药。选择抗病力强的品种，种植前将种子和地块彻底处理，发病时及时喷洒药剂防治，以免病情恶化、扩散。性病害可用普力克、扑海因等药剂防治，效果较好。
防治要点：
①选用抗病品种，选无病植株采种。
②种子采用50℃温水浸种30分钟，冷水洗净晾干播种。
③选地势较高、易排水地块种植或采用高畦、半高畦栽培。
④避免轮作2年以上。
⑤注意清除病残体。
⑥加强肥水管理，亩施腐熟有机肥2000公斤，增施磷、钾肥；干旱注意浇水，雨后排涝。
⑦发病初期每隔7～10天喷药一次，连续2～3次。
霜霉病可选77.2%普力克800倍液，64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、80%壮生可湿性粉剂500倍液；灰霉病可选50%速克灵可湿性粉剂1500～2000倍液，50%扑海因可湿性粉剂1500～2000倍液；紫斑病可选用64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液或50%扑海因可湿性粉剂1500倍液。化学防治中，大棚内应采用烟雾剂或粉尘法降低棚内湿度，喷雾时农药交替或混合使用。
细菌性病害主要是洋葱软腐病，症状为上部叶片黄化，下部磷茎处水渍状腐烂，有恶臭味。防治要点：
①避免连作。
②追肥时避免撒到心叶处。
③注意消灭地下害虫。
④浇水时忌大水漫灌。
⑤化学防治可采用72%农用链霉素可溶性粉剂3000倍液或58%增效瑞酮600倍液。
洋葱黄叶枯萎可能是种植土壤不适合生长，后期可更换土壤重新栽种；也可能是养护时水肥不当，后期需严格控水控肥；还可能是过强光照灼伤，后期需适当遮阴。
