选择适龄且丰满健壮和抗杂性强的优质菌种,播种时加大播种量,减少该菌的发生。选择合适的栽培时间,尽量错开梅雨季节,如在初秋拌料栽培时减少有机物辅料用量,以防杂菌污染和减少感染机会。生料栽培时发酵要彻底,熟料栽培时灭菌要严格、彻底。严防瓶盖纸或棉塞受潮,播种后控温在24~27℃,湿度70%左右,同时加强通风换气,这样才能适应和满足木耳的生长条件,减少和控制杂菌污染的机会。经常检查、翻袋、调节上下不均衡现象。如发现少量局部污染时,及早用5%可湿性托布津或甲醛500倍液,注入感染部位,然后用胶布粘贴针眼,可控其蔓延。严重污染的用0.1%多菌灵溶液浸纱布或报纸,覆盖后拣出培养室烧毁或深埋。出耳期污染的菌袋(或耳),可用工具刮去被污染的料面,然后用石灰粉撒于危害的部位,并用0.1%多菌灵溶液浸纱布或报纸后覆盖,可防止该菌蔓延。