花生茎腐病自苗期至收获期均能发病，但以苗期受害较多。幼苗期花生感病，子叶受到浸染呈黑褐色，病菌沿子叶扩展危害幼苗根颈部，形成黄褐色水渍状不规划病斑，后期呈黑褐色，使茎基部腐烂。发病初期出现不规则状褐色斑块，后变黑褐色，并纵横扩展，最后绕茎一周形成环形病斑。
成株期发病时，主茎和侧枝基部产生水渍状黄褐色斑，病斑发展后使茎基部变黑枯死。维管束变黑褐色，输导组织被破坏，地上部失水萎蔫枯死，故俗名“掐脖瘟”。在土壤潮湿时，病部表皮呈黑色软腐，后期病斑上着生小黑粒点，是病菌的分生孢子器。土壤干燥时，病部表皮呈琥珀色透明状，紧贴茎上，内部组织变褐干腐，茎部髓干缩。
病菌从子叶或幼根侵入植株，在根颈部产生黄褐色水渍状病斑，后变黑褐色，引起根基组织腐烂。当潮湿环境时，病部产生分生孢子器（即黑色小突起），病部表皮易剥落，纤维组织外露。当环境干燥时，病部表皮凹陷，紧贴茎上，成株期感病后，约10～30天全株枯死，发病部位多在茎基部贴地面，有时也出现主茎和侧枝分期枯死现象。
