棉苗炭疽病的发生受气象因子影响显著,尤其温度与湿度是决定病害流行的关键因素。湿度是病菌孢子发芽入侵的必要条件,土壤水分过多且相对湿度在85%以上时,炭疽病危害加剧;湿度低于70%时,则不利于发病。温湿度密切相关,连续阴雨导致温度下降,不利于棉苗生长,易诱发病害流行。炭疽病的初侵染源主要为带菌种子,棉籽带菌率通常为30%~80%。种子萌发时病菌开始危害,可通过风、雨、昆虫和灌溉水传播,再侵染无病棉苗。若相对湿度持续90%以上且阴雨天气超过5天,日平均气温在20-25℃时,病害可能大流行。大风暴雨造成枝叶损伤,利于病菌侵染和传播。棉蚜为害严重的棉田,蚜虫造成的伤口增多,茎枯病也较重。连作棉田和苗期长势瘦弱的棉田发病更严重。