锈病分为条锈、叶锈和杆锈三种，其特点均以孢子堆分别在叶面、叶鞘和茎杆、麦芒上出现锈斑。条锈病一般发生在小麦拔节至抽穗阶段，防治重点应是产量较高、发病较早或发病虽晚但成熟迟的感病品种麦田。叶锈病一般在孕穗至抽穗期发生。杆锈病从开花至乳熟阶段出现，以晚播、产量水平较高的感病品种麦田为防治中心。小麦植株形成伤口，造成水分、养分的流失，并使叶绿素受到破坏，制约小麦的发育与生长，进而导致小麦产量大幅下降。
小麦条锈病发病部位主要是叶片，叶鞘、茎秆和穗部也可发病。初期在病部出现褪绿斑点，以后形成鲜黄色的粉疱，即夏孢子堆。夏孢子堆较小，长椭圆形，与叶脉平行排列成条状。后期长出黑色、狭长形、埋伏于表皮下的条状疱斑，即冬孢子堆。
小麦叶锈病发病初期出现褪绿斑，以后出现红褐色粉疱(夏孢子堆)。夏孢子堆较小，橙褐色，在叶片上不规则散生。后期在叶背面和茎秆上长出黑色阔椭圆形至长椭圆形、埋于表皮下的冬孢子堆，其有依麦秆纵向排列的趋向。
小麦秆锈病为害部位以茎秆和叶鞘为主，也为害叶片和穗部。夏孢子堆较大，长椭圆形至狭长形，红褐色，不规则散生，常全成大斑，孢子椎周围表皮撒裂翻起，夏孢子可穿透叶片。后期病部长出黑色椭圆形至狭长形、散生、突破表皮、呈粉疱状的冬孢子堆。
三种锈病症状可根据其夏孢子堆和各孢子堆的形状、大小、颜色着生部位和排列来区分。群众形象的区分3种锈病说：“条锈成行，叶锈乱，秆锈成个大红斑。”
