辣椒根腐病的防治方法：
(1)精选品种。选好并整好育苗地块。选择优质品种，并对种子进行浸种+种衣剂处理，并适期播种。
(2)实行与豆科、禾本科作物进行3～5年轮作。
(3)田间管理。①精耕细整土地，悉心培育壮苗，在移植时尽量不伤根，精心整理，保证不积水沤根，施足基肥。②定植后要根据气温变化，适时适量浇水，防止地上水分蒸发、苗体水分蒸腾，隔绝病毒感染。要喷施促花王3号，促花芽分化，多开花，多坐果。③分别在花蕾期、幼果期、果实膨大期喷施辣椒壮蒂灵，增强植株营养匹配功能，使果蒂增粗，促椒体健康生长，增强抗病能力。
(4)定植后温度控制在20～30℃、地温25℃、湿度不高于90%。使幼苗茁壮成长。
在发病初期可喷淋或浇灌50%多菌灵可湿性粉剂600倍液，或40%多·硫悬浮剂600倍液，或50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500倍液，隔10天左右喷或灌1次，连续灌2～3次。发病初期开始喷洒或浇灌36%甲基硫菌灵悬浮剂600倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液、50%多菌灵可湿性粉剂800倍液、40%混杀硫胶悬剂500倍液。在植株最初开花结果时，施用清枯立克500倍液沿茎基部进行灌根，7天左右用药1次，能有效的防治辣椒根腐病。
