辣椒疫病是一种毁灭性病害，应采用综合防治方法。首先，选用抗病品种，如洛椒系列品种表现较强的抗病性。其次，合理轮作，与非瓜类、茄果类蔬菜实行2年以上轮作。加强栽培管理，采用地膜覆盖、深沟高畦，严防菜地积水，控制浇水；及时拨除病株，集中烧毁或深埋，减少再侵染菌源。加强通风，降低湿度。
药剂防治的关键是在雨季来临之前5～7天开始用药，喷雾与灌根相结合。定植前可用25%瑞毒霉或75%甲霜灵800液灌根，5～7天一次。定植后，发病初期可用64%杀毒矾可湿粉剂500倍液喷雾、800倍液灌根；77%可杀得可湿性粉剂500倍液喷雾、800倍液灌根；58%甲霜灵锰锌500倍液喷雾、800倍液灌根。每隔7～10天喷一次，连续2～3次，严重时每隔5天喷一次，连续3～4次。不同药剂可以交替使用，以达到较好的防治效果。棚室保护地还可选用百菌清烟剂和粉剂防治，即在发病初期用45%百菌清烟雾剂，每667平方米每次用250克，每7～10天一次，连续2～3次；或者用5%百菌清粉尘剂每667平方米每次1千克，每7～10天一次，连续2～3次。发病初期还可用58%甲霜灵锰锌400倍液、72.2%普力克水剂700倍液、72%霜脲锰锌800倍液、55%福·烯酰可湿性粉剂700倍液或50%嘧菌酯水分散粒剂2000倍液全株喷雾，重点喷洒果实，每隔7～10天喷1次，连喷2～3次。
疫病是辣椒的一种土传病害，各地均有分布，全生育期均可发病。发病周期短、流行速度迅猛异常，一般株发病率20%-30%，重病田块达70%以上，严重影响辣椒产量，甚至绝收。
