芹菜黑腐病的病原以菌丝附在病残体或种子上越冬。播种带病的种子,长出幼苗即猝倒枯死。借风雨或灌溉水传播,从植株表皮侵入,形成初侵染再侵染。病部产生分生孢子借风雨或灌溉水传播,孢子萌发后产生芽管从寄主表皮侵入进行再侵染,生产上移栽病苗易引起该病流行。