整个生育期均可感病，苗期染病子叶变黄枯萎，幼叶现浓、淡绿相间的花叶斑驳。成株染病开始嫩叶呈黄绿相间状花叶，有明脉，病叶小不舒展，后出现皱缩，严重的叶反卷，质脆，植株矮化，下部叶片逐渐黄枯。瓜条染病，出现深、浅绿相间状斑块，果面凹凸不平或畸形。重病株，节间短且弯曲，上簇生小叶，不能结瓜，导致萎缩。植株生长期间现黄色花叶或花叶，一般心叶发生多，多表现为轻型花叶，有时心叶现皱缩花叶，向后翻卷，严重的植株矮化。花叶病毒病主要是发生在冬天大棚种植香菜时，香菜植株上会出现黄色的叶子，发病最严重的是以心叶为主。会造成香菜矮小，无新根新叶，最后导致枯萎而亡。香菜花叶病毒病主要为害叶片。