防治小麦纹枯病的特效药包括井冈霉素、丙环唑、多抗霉素等。防治措施可在播种期进行拌种,或在翌年春季冬、春小麦拔节期进行药品喷施。春季喷药防治一般在病株率达到15%时施药,需经常调查,达到防治指标的田块及时喷药。井冈霉素对小麦纹枯病仍有较好效果,但持效期较短,对发病较重的田块应采用高药量大水量的方法,即每亩用5%井冈霉素水剂300~350毫升,或20%的井冈霉素可溶粉50~60克,加水50~75公斤喷洒,隔7~10天一次,连续防治2~3次。一般杀菌剂都可预防,但最佳办法是合理密植,减氮肥,增磷钾肥,保持田间良好的通风透光性,减少发病条件。如果田间出现纹枯病,应及时用药防治,越早越好。常用杀菌剂有三唑酮、苯醚甲环唑、烯唑醇、己唑醇或井冈霉素等。若某些药剂在当地抗性大,建议更换使用。一次未防治住,间隔一周到十天左右再进行一次。