黄喉拟水龟栖息于丘陵地带、半山区的山问盆地和河流谷地的水域中，有时也常到灌木草丛、稻田中活动。白天多在水中戏游、觅食，晴天喜在陆地上，偶尔爬到岸边晒太阳。天气炎热时，上午、傍晚后活动较多，中午、夜晚常躲在水中、暗处或埋入沙中，缩头不动。每年的4月底至10月初活动量大，最适环境温度为18-32℃。13-15℃是龟南活动状态转入冬眠状态的过渡阶段，10℃左右龟进入冬眠。在35-36℃，龟不适应或蛰伏不动。3月上旬温度15℃左右，龟虽已苏醒，但只爬动，不觅食。到3月底至4月初才进食，冬眠后的体重大约减轻50-100克。杂食性，取食范围广，包括禽畜肉及内脏、植物类的瓜果蔬菜，喜在水中觅食。若食物过大，则借助两前爪将食物撕碎后再吞食。人工养殖时则以人工配合饲料为主。