一般本田施肥按水稻的生育过程分为前、中、后三个时期。前期是指从移栽至分孽终止，即水稻的营养生长阶段，此时以促进有效分粟和争取多穗为目标；中期是指水稻进入生殖生长阶段（花粉形成时期），此时以壮秆攻大穗为目标，但施肥不能过多；后期是指水稻从抽穗到成熟的时期，此时以攻粒多、粒饱为主，既要保证不脱肥，又不能贪青晚熟。
选育和选用抗病品种必须与病菌生理小种类群、分布及其出现频率的变化规律相结合，注意经常更换新品种并合理布局、搭配，提高群体的抗病能力，这是防治稻瘟病的关键措施。消灭越冬病源的方法包括：1. 处理病稻草，发病稻草应迁入室内，不能放在野外，也不能用来捆秧、盖草房或搭围墙，野外稻草应处理干净；2. 种子处理，将预浸12小时后的谷种在2％福尔马林液中浸3小时或在500倍液的强氯精溶液中浸种12小时后，取出用清水洗净再浸种，通过种子处理后，基本上无苗瘟发生。
根据水稻品种抗性、种植感病区域和稻瘟病的症状识别，防治方法包括：选择抗病品种、药剂拌种、科学施肥，一旦发现病害，选择对症药剂适时防治。
