在存放剩余农药前要仔细阅读使用说明书，保存好农药的标签及使用说明书。要注意实行密封，保管时一定要把瓶盖拧紧，保证密封。要注意保持温度，不能过高或过低。要注意保持干燥，粉剂农药和植物调节剂易吸潮结块，保管存放农药的场所应当保持干燥。要注意分类存放，农药从化学性质上可分为碱性、酸性和中性。
在保管时最好存放在专柜或木箱中，并要在外面加锁，再贴标签。农药不能与粮油、豆类、种子、蔬菜、食物以及动物的饲料等同室存放。乳油剂和烟熏剂农药不能和易燃易爆物品（如火柴、汽油、机油、鞭炮等）放在一起，更不能存入室内或畜禽舍内以及附近，特别注意不要放在小孩可接触的地方。农药的纸包装物品和药瓶，绝不能用来盛粮食、食品和饲料。用棕色瓶子装着的农药一般需要避光保存。