给甜菜施肥的方法归纳起来有基肥、种肥、追肥、叶面施肥、营养液浸种、营养层种子包衣等6种方法。基肥：一是撒施，即在秋翻地或春翻地前，采用人工或机械，将肥料均匀撒在地表，经过翻、耙、起垄等过程，将肥料均匀搅拌到垄内。二是在翻地后，与起垄同时将肥料夹在垄中间。三是采用“三犁川”施肥法，即在上茬垄作作物地上，不进行任何耕翻，将肥料条施在原垄的垄沟上，然后破旧垄的垄台合新垄，将肥料合在垄底。后两种方法施肥集中，可提高肥料当年的利用率。
种肥：一是穴施，适合于穴播地区，在播种穴距种子5厘米左右按穴抓把肥。这种方法的优点是肥料集中，幼苗根系容易吸收周围的养分，但在干旱年份应控制肥料用量，防止烧苗。二是条施，适合于机械化播种的地区，在播种时利用播种机上的施肥器，将肥料均匀条施于种子下方。这种方法施肥量和深度均匀，播种质量高，不易产生烧苗现象。
追肥：在定苗后于土壤中再补施一定量的肥料，一般采用穴施和条施。穴施是在甜菜株一侧或两株中间刨一个10厘米左右的坑，放入肥料后覆土。条施是采用机械施肥，在距株一侧8～10厘米处，将肥料施入10～15厘米深处。追肥结合中耕或灌水进行效果更好。
以有机肥为主，配施化肥。甜菜想要高产，就需要施入充足的基肥，而且有专业种植户介绍，施入的有机肥越多，产量也会增加，所以种植甜菜前，在土壤表层需要施入充足的腐熟有机肥，来保证甜菜生长需要的肥料供应。有机肥为主，化肥为辅。在施入有机肥作基肥时，然后配合施入适量的尿素和过磷酸钙，将磷肥做种肥。然后追施尿素和硫酸钾。
种肥：甜菜幼苗期，施入磷肥作种肥，能满足甜菜对速效养分的需求，一般以氮磷肥为主，如果缺钾的土地，还可以配合适量的钾肥。追肥：追肥主要施入氮肥，并配合施入磷钾肥。施肥量依据甜菜的长势决定。追肥后要合理浇水，撒施3-5kg尿素。
氮磷钾比例协调。氮磷钾肥的施用比例很关键，会直接影响甜菜的产量，氮肥施用量要控制，并配施磷钾肥，对于磷钾肥含量低的土壤应适度提高磷钾肥用量。重视微量元素肥的施用。在甜菜苗期、叶丛繁茂期喷施微量元素肥，可以改善甜菜糖度。