马铃薯黑心分为病理性和生理性两种表现。病理性黑心由黑胫病引起，发病时植株矮小、僵直，叶片黄化，小叶向上卷曲。后期茎部变黑腐烂，植株枯死，薯块从匍匐茎处开始腐烂变黑，并向内发展形成黑心。高湿环境加速发病，腐烂后伴有恶臭。病理性黑心在生长期和贮存期均可能发生。
不宜与茄科作物（茄子、辣椒、番茄、烟草等）及红薯、胡萝卜、甜菜等块根作物轮作。长期重茬种植会导致土壤微量元素失衡，引发马铃薯烂根、死棵、僵苗、不发根及产量低、品质差等问题。重茬还会导致青枯病、疮痂病、粉痂病、黑痣病、软腐病等土传病害，并造成土壤板结、酸化、积毒。大量使用化肥会破坏土壤团粒结构，使磷、钾及微量元素固化失效，土壤通透性变差。氮肥过量使用导致土壤酸化，除草剂和农药过度使用造成土壤积毒，肥力退化，作物早衰。
