锈病危害向日葵植株地上部分的各个器官，特别是叶片受害最重。通常在向日葵叶片浓密的时期，或者开花后开始表现症状。叶片、叶柄、茎秆、葵盘等部位染病后都可形成铁锈般状孢子堆。叶片染病，初在叶片背面出现褐色小疱是病菌夏孢子堆，表面破裂后散出褐色粉末，即病原菌的夏孢子，后病部生出许多黑褐色的小疱，即病菌冬孢子堆，散出黑色粉末，即冬孢子，发生严重的致叶片早期干枯。向日葵锈病主要危害向日葵的叶片。苗期发病，发病初期，受感染的叶片两面产生黄褐色小斑点，之后病叶上出现圆形或近圆形黄褐色小疱，后逐渐破裂，露出铁锈色粉状物，以后多于叶背面长出橘黄色锈状颗粒。到夏末秋初，在夏孢子堆周围形成大量黑色小疱，破裂后散出黑褐色粉末。发生严重时叶片上布满褐色小疱，通常中下部叶片发病较重。生长发育受抑制，果实瘦小，营养价值降低。抗病植株叶片上仅出现褪绿圆点。