为了有效防治玉米纹枯病，可以采取以下综合措施：
1.清除病原：及时深翻土壤，消除病残体及菌核。发病初期摘除病叶，并用药剂涂抹叶鞘等发病部位。
2.选用抗病品种：选择抗（耐）病的品种或杂交种，如渝糯2号（合糯×衡白522）、本玉12号等。
3.轮作与合理密植：实行轮作，合理密植，注意开沟排水，降低田间湿度，结合中耕消灭田间杂草。
4.药剂防治：
使用浸种灵按种子重量0.02%拌种后堆闷24～48小时。
发病初期喷洒1%井冈霉素0.5kg对水200kg或50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500倍液、50%多菌灵可湿性粉剂600倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液、50%退菌特可湿性粉剂800～1000倍液。
也可用40%菌核净可湿性粉剂1000倍液或50%农利灵或50%速克灵可湿性粉剂1000-2000倍液。
喷药重点为玉米基部，保护叶鞘。
5.提倡使用移栽灵混剂：在发病初期喷洒，具体方法见移栽灵混剂使用指南。
6.综合防治：
避免种植过密和氮肥施用过量;做好中耕除草，修理好排水沟;摘除下部老叶，尤其是剥去发病叶鞘。
玉米收获后清除带病的残株，并且深翻土地，减少越冬菌源。在发病初期摘除的病叶要带出田间集中烧毁。
在发病初期(玉米拔节时)，用井冈霉素、菌核净、苯甲？丙环唑、戊唑醇等进行喷雾防治，重点喷茎杆中下部，5～7天后再用药1次。
防治玉米纹枯病可在玉米生长中期在茎基喷施药剂，间隔7～10天1次。适合药剂有：多井悬浮液、菌核净、井冈霉素、退菌特等。
防治纹枯病的最有效时期在灌浆初期，利用井冈霉素平均防效可达75%左右。若在该时期先剥除病叶，再用井岗霉素加以保秆，其防效可达94%。
