小麦病害的发生与多种因素相关，包括早播、多雨、少日照、连作等条件，这些因素从小麦播种出苗到越冬期间都会促进病害的大量发生。春季多雨和低温持续时间长会延长病害的发生期。然而，随着小麦进入拔节期后温度的升高，受影响的植株通常能够恢复正常生长，不再显示病害症状。
播种量对病害的发生也有一定影响。在秋季雨水多、阳光少的条件下，当小麦的播种量超过11.5公斤/亩时，播种量越大，病害的发生越严重。但在降雨量正常或较少、日照充足的年份，播种量对病害发生的影响则不明显。
小麦花叶病病菌主要通过病土、病根残体和病田水流传播，其传播媒介是土壤中的禾谷多黏菌，这是一种小麦根部的专性弱寄生苗。而小麦黄矮病是由病毒侵染引起的，其主要传播媒介是蚜虫，尤其是麦二叉蚜的传毒能力最强。
小麦黄矮病的发生程度主要取决于麦蚜的虫口密度，同时也与气候因素、耕作栽培条件和病毒源等有关。例如，如果上年10月的平均气温高，降水量小，且当年1、2月的平均气温也高，这些条件有利于麦蚜的取食繁殖、传播病毒、安全越冬及早春活动，从而可能导致麦蚜与小麦黄矮病的大发生和流行。此外，早播麦田、点播稀植、阳坡地、旱地、路边地头以及缺肥、缺水、盐碱瘠薄地等条件下，小麦黄矮病的发生通常较重。
