辣椒疫病是一种毁灭性病害，应采用综合防治方法。防治措施如下：
1.选用抗病品种。辣椒较抗病，甜椒较感病。如洛椒系列品种，均表现较强的抗病性。
2.合理轮作。与非瓜类、茄果类蔬菜实行2年以上轮作。
3.加强栽培管理。采用地膜覆盖，深沟高畦，严防菜地积水，并控制浇水；注意田园整洁，及时拨除病株，集中烧毁或深埋，以减少再侵染菌源。加强通风，降低湿度。
4.药剂防治。药剂防治的关键是在雨季来临之前5～7天开始用药；喷雾与灌根相结合。一般宜在定植前用25%瑞毒霉或75%甲霜灵800液，5～7天灌一次根。定植后，发病初期可用64%杀毒矾可湿粉剂500倍液喷雾、800倍液灌根；77%可杀得可湿性粉剂500倍液喷雾、800倍液灌根；58%甲霜灵锰锌500倍液喷雾、800倍液灌根。每隔7～10天喷一次，连续2～3次，严重时每隔5天喷一次，连续3～4次。不同药剂可以交替使用，以达到较好的防治效果。
