严格执行检疫措施,严禁到疫区引进果实、种子和带土苗木。加强果园管理,冬季翻耕园土可杀死部分越冬蛹;在秋、春季成虫羽化之前进行中耕,破坏蛹的生成环境,减少虫源,降低羽化率;摘除受害青果晒干以杀死卵和幼虫;9~10月受害果刚出现症状、幼果脱落前摘除受害果,煮沸或深埋以杀死幼虫。物理防治包括:果实套袋可有效防止雌性成虫在果上产卵,降低果园的柑橘大实蝇种群数量,提高水果的产量;成虫羽化开始后进行诱杀,如频振式杀虫灯、糖醋液、蛋白质引诱、性诱剂等;用辐照处理雄成虫,使其不能正常繁育后代,控制种群数量。化学防治关键是在成虫出土和幼虫入土时地面喷药,药剂有65%辛硫磷1000~2000倍液,90%敌百虫或80%敌敌畏1000倍液,20%灭扫利或20%杀灭菊酯或2.5%溴氰菊酯2000~3000倍液。