水分管理是秋番茄栽培的关键措施。在炎热夏季,为降低土温、防止病毒病,应经常灌溉。但是水分过多,尤其是土壤积水,易引起植株徒长、沤根、落花,因此最好选择排水良好的壤土或沙壤土，采用高畦栽培。除施基肥外,在果实膨大期应追肥2~3次。定植成活后浇施速效肥，注意控水蹲苗，待第一花序座果后开始膨大时重施复合肥，同样之后花序座果后呈乒乓球大时追肥。同时要注意浇水保持土壤湿润，不可过干，也不可过湿，雨天注意排渍。
番茄生长适宜的土壤湿度为：缓苗期65%-75%，缓苗后到结果初期80%，盛果期可达90%；各时期的湿度均不能低于50%。土壤湿度通过灌水与控水来维持适宜的标准。在施足基肥的情况下，仍需合理追肥。追肥办法是：缓苗后至开花前轻施一次速效性复合肥，每亩用量10-15公斤。
番茄定植后的水肥管理尤为重要。露地栽培的追肥与灌水主要在第一穗果长到核桃大小，第二花序已经坐果时进行第一次追肥。第二次追肥在第三穗果坐果后进行。第三次追肥在第四穗果坐果后进行。每次施肥要合理灌水。设施栽培的秋冬茬，第一花序上的果长至鸡蛋黄大小时，进行第一次追肥浇水，一般亩用硝酸铵20-25千克，顺水冲入膜下沟内；进入盛果期，要集中连续追2-3次肥，并及时浇水，浇水要均匀，忌忽大忽小，随室外气温升高，每周浇一次水。
番茄是半直立性的植物，缓苗后进入旺盛生长时要及时插架，以防倒伏。插架方式有单立架、篱笆架、人字架和四角架等。一般早熟品种可采用单立架；中晚熟品种宜采用篱笆和人字架；而四角架很少采用。植株调整的一个重要内容是选取合适的整枝方式。整枝摘芽过程中，应强调适时，不宜过早或过晚。植株调整还包括摘叶及摘心等工作。
番茄果实在成熟过程中可分为4个时期，即青熟期、转色期、坚熟期和完熟期（亦称软熟期）。
