大豆缺钙时,幼苗顶端焦枯,生长点和新叶凋萎死亡,子叶变厚、卷曲;叶柄与叶片交接处也呈暗褐色;根呈暗褐色,脆弱,呈黏稠状;严重时茎顶卷曲呈沟状枯死。幼苗期缺钙,胚叶基部出现大量黑斑、胚叶边缘出现黄色,顶芽坏死,子叶变厚、卷曲。初生叶叶缘收缩,叶成杯状,叶尖出现黑斑。开花前1个月内缺钙会引起基部三出叶边缘出现带有蓝色的斑点,叶深绿色,整个叶片斑纹密集成皱,茎秆木质部分软化。新叶不伸展,老叶有灰白色斑点。叶片从叶中部和叶尖开始黄化,产生棕色小点,叶缘、叶脉仍绿色,叶缘下垂、扭曲,叶小、狭长,叶端呈尖钓状。严重时,叶脉变棕色,叶柄柔软下垂,上部叶腋中长出新叶,不久也变黄,延迟成熟。根暗褐色,脆弱,呈黏稠状,叶柄与叶片交接处呈暗褐色。严重时顶芽枯死,茎顶卷曲呈钩状枯死。在结荚期缺钙,叶黄绿,并带有红色或淡紫色,荚果深绿或褐绿色,带有斑纹,叶子脱落延迟。缺钙植株长势弱,易于发病。