化学防治是种植不抗病或抗病能力弱品种时的重要措施，尤其适用于长势好、产量高、发病较重的地区和麦田。常用药剂包括：
1.三唑酮（粉锈宁）：每亩用有效成分8克，在小麦孕穗至抽穗阶段喷洒1次，可控制病害并兼治小麦锈病。秋苗发病较多的地区，可用种子重量0.03%的三唑酮拌种，有效控制秋苗期病情，减少越冬菌量，兼治黑穗病和秋苗期锈病。
2.保丰宁、植保宁、复方粉锈宁：防治效果良好，用量用法与三唑酮相同。
3.三唑醇（羟锈宁）：施用方法与三唑酮相同，用药量减半。
4.硫制剂：如波美0.5～0.8度石硫合剂、胶体硫200倍液、50%硫磺悬浮剂每亩0.5千克，一般需喷2次以上，每次间隔7天，喷药时间应提早。
