选用耐病品种：选用株型紧凑，尖叶或叶片上举，通风透光性能好的耐病品种。从无病留种田留种或清除混杂于种子间的菌核。轮作倒茬：防治大豆菌核病的最基本措施是合理轮作。大豆与禾本科作物轮作倒茬，可显著减少田间菌核的积累。发病严重的地块，应与河谷类作物轮作三年以上，避免重茬、迎茬，不能与聚合并的寄主植物如菜豆、马铃薯、油菜、向日葵等轮作。加强田间管理：对发病的地块进行深耕，将菌核深埋在土壤中，抑制菌核萌发，减少侵染来源；排水不良的地块，应平整土地及时排水，降低大豆田间湿度；在封垄前中耕培土，破坏萌发的子囊盘；适当控制氮肥量，增施钾肥。病田收获后，应将病残体收集烧毁，消灭菌源。
大豆菌核病是由核盘菌引起的病害，主要出现于大豆的苗期、花期及花荚期，危害叶片、豆荚及茎杆。苗期感病，植株茎部会出现水渍状或棉絮状的菌丝；花期感染会出现植株枯萎、茎叶腐烂现象，后期全株会干枯萎缩而死。该病主要造成茎秆腐烂，病变部位苍白色，茎杆内中空并有黑色菌核，易折断，结荚少或不结荚。在流行年份减产20-30%，严重地块减产达50-90%，甚至绝产。田间菌核数和环境因素是病害发生轻重的重要因素。大豆菌核病是土传病害，初侵染来源主要是土壤中的菌核，防治应以预防初次侵染为主，减少豆田中菌核数量是关键。
