芹菜软腐病是通过多种途径传播的细菌性病害。病原菌主要随病残体在土壤中越冬，次年温湿度适宜时，通过昆虫、雨水或灌溉水等从伤口侵入，发病后可通过雨水或灌溉水传播蔓延。病菌在4℃-36℃内均能发生，最适温度为27℃-30℃，不耐干燥和日光。由于病菌的寄主广，一年四季均可在各种蔬菜上侵染和繁殖，对各季栽培的芹菜均可造成危害。
芹菜软腐病的传播和发生与土壤、植株的伤口及气候条件密切相关。有伤口时病菌易于侵入，高温多雨时植株上的伤口更不易愈合，发病加重，容易蔓延。病菌主要随病残体在土壤中越冬，通过昆虫、雨水和灌溉及各种农事操作等传播，病菌从芹菜的伤口处侵入。在温暖地区，病菌没有明显越冬期，在田间周而复始传播扩展。
防治芹菜软腐病的方法包括实行两年以上的轮作，避免伤根或使植株造成伤口，定植不宜过深，培土不应过高，雨后及时排水，发现病株及时清除，并撒入石灰等消毒，发病期减少或停止浇水，防止大水漫灌。及时防虫，清洁田园，田间出现病株后立即拔除，并用药液及时处理，浇灌病株及其周围健株，可减轻发病。
